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《自然评论·临床肿瘤学》重磅综述:MSKCC团队一文讲透罕见分子...

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一秒钟 发表于 2023-2-27 04:05:29 | 显示全部楼层 |阅读模式
作者:奇点肿瘤探秘
*仅供医学专业人士阅读参考

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说到治疗进展风驰电掣的肺癌,大家在过去几年里印象最深的进步是什么?奇点糕觉得,哪怕是站惯了C位的免疫治疗,也得给另一群明星们让让位,因为针对罕见突变的靶向治疗,绽放的光芒实在太耀眼了。

RET重排、ROS1融合、NTRK融合、MET ex14突变、KRAS-G12C……一个个突变频率不超过5%的罕见靶点,过去几年内相继有药可用,这对肺癌治疗的意义可绝不只是指南上多出几页推荐,而是数以万计的患者,抗癌历程将被彻底改写。

而在已获成功的靶点以外,还有许多肺癌罕见靶点的精准治疗正在一路狂飙,这些罕见亚型肺癌的分子和临床特征、关键信号通路、检测和治疗要点,也是临床工作者们应该不断学习、融会贯通的重要知识,毕竟不能打无准备之仗嘛。

近期在《自然评论·临床肿瘤学》(Nature Reviews Clinical Oncology)上,纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSKCC)等知名癌症中心的专家就共同撰文,详尽盘点了已知的各罕见分子亚型肺癌,从分子特征、诊治现状到新药研发一网打尽,这篇好文可绝对不容错过[1]!

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论文首页截图

罕见分子亚型肺癌概述

许多突变频率不超过5%的罕见分子亚型肺癌,其实也符合罕见癌症(一般指发病率<6/10万人)的定义,但由于全球肺癌患者的基数十分庞大,往往仍对应着2-9万人之多的患者,甚至会超过淋巴瘤、白血病等一些恶性肿瘤的患者总数。

单就这一点,推动罕见分子亚型肺癌的治疗也非常重要,撰文专家们在综述中将罕见分子亚型肺癌分为两类,一类是知名度已较高的ROS1RET等亚型,另一类目前认知则有限,例如HRAS/NRAS、非V600E-BRAF突变等。

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各种罕见分子亚型在肺癌中的发生频率

对这些罕见分子亚型的探索,也不是完全无迹可寻,因为一些基因变异在结构、通路和功能上,与已知的肺癌驱动基因变异颇为相似,经验或许也可以借用,例如HRAS/NRAS突变与KRAS突变,RET/ROS1RASGRF1融合就是典型的例子。

基于分子特征对罕见分子亚型肺癌分类

突变型

这类罕见分子亚型中最常见的是编码受体酪氨酸激酶(RTKs)的基因突变,如METHER2EGFR 20号外显子突变、DDR2突变等,以及MAPK信号通路上的KRAS/NRAS/HRASBRAFRAF1等突变,很多都在肺癌中符合罕见的标准。

除根据突变基因种类进行分型外,还可以根据突变模式来分型,例如常见的错义突变(如KRAS等)、插入/缺失突变(如EGFR/HER2 20号外显子插入突变),以及较少见的激酶区扩增等。

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编码RTKs的肺癌罕见突变

融合型

融合基因可分为三类:1)RTKs编码基因,如ALKRETROS1等较早被识别的融合基因,往往存在一个完整的激酶结构域;2)涉及MAPK信号通路的基因,如RASGRF1融合等;3)RTK配体编码基因,如NRG1/2融合,相对少见。参与融合的“伴侣基因”来源更广,像ALK这类伴侣较固定(EML4)的基因并不多。

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融合基因的结构、激活信号通路及在细胞中的位置

拷贝数改变型

目前已证实HER2METFGFR1等基因在肺腺癌中存在拷贝数扩增,而研究较多的是与EGFR酪氨酸激酶抑制剂(TKI)类靶向药有关的扩增变异,此外KRASBRAF等基因也存在扩增现象。

不管是突变、融合还是拷贝数扩增,往往都会导致RTKs活性增强(配体依赖性/非依赖性),持续激活下游的MAPK、PI3K、PKC和JAK-STAT等信号通路而促癌,具体到每一种罕见突变都是一篇大文章,此处就不做详述了。

罕见分子亚型肺癌的特征

绝大多数肺癌罕见基因变异都多见于肺腺癌,但也有多见于鳞癌的DDR2突变、FGFR1扩增等,其中一些罕见分子亚型具有较明显的形态学特征,如ALK/ROS1/RET融合肺癌往往存在大量细胞外黏蛋白、筛状结构和印戒细胞,且更易在年轻、不吸烟/吸烟少的患者中检出,同时也有很多研究提示亚裔、女性患者的检出率高。

但也有一些罕见变异“反常”,例如多见于老年患者的MET 14号外显子跳跃突变(MET ex14+),此外一些罕见靶点还好发于特定类型肺癌,如肺肉瘤样癌中MET ex14+检出率更高(7-30%),肺浸润性黏液腺癌中多见NRG1融合(约30%)等[2],但由于相关分析的患者数普遍有限,结论还需要更多数据支持。

除临床和病理特征外,罕见分子亚型肺癌的另一特点,就是对化疗和免疫治疗普遍不敏感,只有少数例外情况,如ALK/ROS1/RET融合肺癌对含培美曲塞的化疗应答较好;而由于罕见分子亚型肺癌大多为免疫“冷肿瘤”,免疫检查点抑制剂们碰了一头包,但PD-L1高表达的MET ex14+患者又是反例,免疫治疗效果较好[3]。

罕见分子亚型肺癌的诊断

基因测序手段的快速发展,全面改变了罕见分子亚型肺癌的诊断模式,既往针对单基因的FISH、PCR等传统检测,已经让位给更高效全面、性价比也更高的二代测序(NGS)检测,尤其是可覆盖数百个基因的大Panel NGS检测全面应用,极大地提高了罕见基因变异的检出率,也发现了更多此前未知的罕见变异。

但当前使用的NGS主要基于DNA检测,存在不少待解决的问题,如对融合基因的检测敏感性有限,难以捕捉内含子(区域较大,探针长度受限)和高度重复序列(如ROS1 31号内含子)等,也难以评估罕见基因拷贝数的扩增。

而基于RNA的检测则可直接评估转录层面的情况,提高检测特异性和敏感性,还可发现新的转录情况和实际未转录的融合基因。近年来已有研究显示,RNA-NGS检测融合基因效果更优,但操作过程中的要求更高,因此可考虑以DNA-NGS作为患者的初检手段,以RNA-NGS用于特定患者的补充检测。

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最优的基因检测策略仍需要结合多种因素进行考量

此外,NGS检测还需以获取足够的肿瘤组织样本作为前提,但临床实践中的活检取样也不是次次成功,因此可考虑以基于ctDNA检测的液体活检作为补充,但受限于血液内的ctDNA丰度,现有液体活检的Panel覆盖基因明显偏少,且普遍采用DNA-NGS技术,优先检测常见基因变异,用于罕见分子亚型检测仍需时日。

除诊断已知的罕见基因变异、发现已知基因的未知变异类型外,学界还需要进一步探索“驱动基因变异阴性”肺癌中可能的罕见基因变异,为此需要更多地应用全基因组/全转录组(WGS/WTS)测序技术。

罕见分子亚型肺癌的靶向治疗现状

小分子药物

针对罕见分子亚型肺癌的小分子药物主要指激酶抑制剂,绝大多数TKI类药物,即靶向不同位点的“XX替尼”都属于该范畴,此外还有靶向BRAF的丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂(如达拉非尼等)和双激酶抑制剂(如曲美替尼)等。

激酶抑制剂类靶向药的作用机制可分为以下几类:1)I型ATP竞争性抑制剂,结合活性态激酶结构域;2)II型ATP竞争性抑制剂,结合非活性态激酶结构域;3)III型抑制剂,竞争结合非ATP口袋附近的别构位点,当然还有根据作用位点、药物发展进程(如第一代/二代/三代ALK-TKI)的分类方法。

基于抗体的靶向治疗

目前已有多种基于抗体的靶向药参与到临床诊疗中,其中双特异性抗体和和抗体偶联药物(ADC)近年来进展迅速,例如靶向MET/EGFR的amivantamab、靶向HER2的T-DXd等都已获批,它们身后还有不少新药蓄势待发。

而从疗效来看,对突变驱动的罕见分子亚型(BRAF-V600E、MET ex14+等)肺癌,小分子TKI治疗的客观缓解率(ORR)一般仅为30-50%,患者中位无进展生存期(PFS)也不超过1年,提示未来或需抗体类靶向药或联合靶向治疗参战。

对融合基因的靶向治疗效果普遍更优,TKI类药物的ORR往往超过60%,患者中位PFS范围则在9-35个月(视治疗线数而定);而对拷贝数扩增为主的罕见亚型,临床探索还非常有限,这与学界尚未就拷贝数扩增的标准达成一致有关,例如MET扩增的Cut-off值仍悬而未决,MET-TKI对哪些患者有效仍难以预估。

进一步提高靶向药物对治疗位点的选择性、改善药物进入中枢神经系统的能力以应对脑转移、应对形形色色的耐药突变,则是罕见分子亚型肺癌靶向治疗的几大关键发展方向,也是在研新药的重要“卖点”。而由于旁路耐药普遍存在,针对罕见分子亚型的药物,还可能参与到EGFR等常见突变亚型肺癌的治疗之中。

如何推动罕见分子亚型肺癌的诊疗进步?

说到领域内研究相关的阻力,头一个肯定就是“罕见”,这会影响制药产业的研发积极性,也必然会使临床研究推进缓慢,因此需要各方面通力合作,打通从疾病科普、基因检测、基础科研、真实世界研究,再到临床药物研发和患者主动参与的全过程,ROS1等罕见分子亚型已经启动了全球性的相关计划。

在推进临床研究和药物审批方面,采用创新模式的篮子试验、雨伞试验更适用于罕见分子亚型,已有监管机构基于篮子试验批准罕见靶点药物上市(如NTRK融合),而FDA等国外监管机构的孤儿药、加速审批、突破性疗法资格等快速通道,也对加速药物上市非常关键,真实世界数据则有望成为临床研究的重要补充。

总结

肺癌的罕见分子亚型研究及诊疗,完全可以作为整个癌症治疗领域的模板,不断的探索也在改写学界对癌症发病机制的认知、优化癌症分子检测手段,而随着越来越多的罕见分子亚型被发现,相关各界都对药物研发、数据扩展和审批流程越发重视,这将加速更多靶向药物的获批,解决患者“无药可用”的困境。

参考文献:

[1]Harada G, Yang S-R, Cocco E, et al. Rare molecular subtypes of lung cancer[J]. Nature Reviews Clinical Oncology, 2023.

[2]Trombetta D, Graziano P, Scarpa A, et al. Frequent NRG1 fusions in Caucasian pulmonary mucinous adenocarcinoma predicted by Phospho-ErbB3 expression[J]. Oncotarget, 2018, 9(11): 9661-9671.

[3]Guisier F, Descourt R, Babey H, et al. Brief Report: First-line Pembrolizumab in Metastatic Non-Small Cell Lung Cancer Habouring MET Exon 14 Skipping Mutation and PD-L1≥ 50%(GFPC 01-20 Study)[J]. Clinical Lung Cancer, 2022, 23(8): e545-e549.

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责任编辑丨谭硕

原文地址:http://mp.weixin.qq.com/s?src=11&timestamp=1677442814&ver=4374&signature=c30XM-q88FvNwNYuUFYXqvA8mEQZ8lZONpyUMD3wPwH5fhzVVRryjtl0D3ekVwWbYH*uFx7pSVpz19L9hrsAu0T88WRFR3A98Wtx8CnpAxxiZrFbIBShY00-J2Sp1ocC&new=1
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