David Bartlett:“基因检测基本上可检测到癌症中存在的所有突变。我们通过对癌症患者进行组织或液体活检并实施基因测序,可确定与该癌症相关的突变,这对使用针对这些特定突变的靶向药物非常重要。虽然并非每种癌症都有靶向药物,但随着时间的推移,越来越多的癌症已开发出针对特定突变的靶向药物。预先了解这些突变信息非常重要。此外,基因检测可以帮助我们判断患者是否有遗传因素,对于有遗传因素的,我们可以给予家庭人员进行相关的筛查,实现早发现早治疗。”
2. 基因检测方法发生了哪些变化?
David Bartlett:“多年来,我们对肿瘤基因组学以及肿瘤中存在的突变的认知不断加深,呈现爆发式增长。以前,我们会在肿瘤中寻找2-3个突变,但现在我们已经能够定期筛查500多个基因,以寻找专门影响癌症的已知突变。我们评估的遗传物质数量、突变数量以及检测效率都得到了提升。最初的人类基因组计划需要13年才能完成一个基因组测序(一代),现在我们使用NGS测序一天就能完成,因此,我们分析这些突变的能力随时间的推移在不断提高。”
David Bartlett:“任何转移性实体肿瘤和血液肿瘤都应该在诊断时进行全面的基因组分析,以便我们寻找所有可能进行靶向治疗的靶向突变,以及随着新药上市而进行临床试验的可能性。目前,基因检测最常用于肺癌和消化道等肿瘤,它可以帮助医生确定患者是否会对靶向或免疫治疗产生反应。对于部分患者来说,免疫治疗可能会改善患者的生存结局,因此,我们要预先知道患者是否有资格接受免疫治疗,这对他们来说可能是变革性的。”
5. NGS是否是基因检测的主要工具?
David Bartlett:“目前,NGS确实是基因检测的主要工具。我们现在是使用NGS进行肿瘤测序的。因为它能一次性检测几十甚至上百个基因,筛查全部用药的可能性,具有通量大、精准度高、信息量丰富的优点,可以在短时间对基因组进行全面的分析,包括TMB和MSI等。”6. NGS的使用和临床应用有什么策略?
David Bartlett:“我认为,目前的关键策略仍然是围绕我们所需要的靶向基因突变进行分析。例如,针对不同的肿瘤类型,我们是考虑定制开发特定的肿瘤panel?还是使用包含所有突变类型的NGS大panel?这很大程度上取决于成本、费用、保险报销以及一些复杂因素。但我们期望发生的是,每个罹患转移性实体肿瘤(及血液肿瘤)的患者都可以进行NGS检测,以确定与癌症相关的所有已知肿瘤突变。这样,我们就拥有了每位接受治疗的患者全面基因组信息,方便制定当前治疗决策,以及后续进展时,使用新药、新临床试验,以及现有的免疫疗法或其他治疗方法。”
7. 基因检测领域还有哪些挑战和机遇?
David Bartlett:“早筛,我们感兴趣的是如何利用这些突变来诊断和筛查癌症,特别是当我们谈论液体活检时。因此,利用某种形式的NGS方法进行肿瘤诊断和筛查,无疑是该领域一个令人振奋的焦点。我们知道,肿瘤,甚至是早期肿瘤,会源源不断将DNA释放到血液循环系统中,如果我们可以利用这一点作为癌症筛查方法,通过NGS检测识别癌症特有突变,那么我们不仅可以确定患者体内是否存在癌症,还可以确定具体是哪种癌症,从而指导进一步的检查。我认为,最令人兴奋的是,我们可以利用这些技术来进行癌症早筛,或检测和随访接受癌症治疗的患者,以了解他们是否对治疗有反应。”
8. 该领域还有其他正在进行的研究吗?
David Bartlett:“有很多令人兴奋的研究都在进行中,比如,如何提高ctDNA的检测灵敏度及如何利用DNA甲基化、片段化等多组学检测,以进行癌症早筛和分子残留病灶(MRD)检测。我认为在不久的将来会有大量令人兴奋的研究,从生物标志物的角度为我们提供更多的癌症研究指导。”