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[精准医学] MEDAL:非小细胞肺癌术后MRD监测(PROPHET方法)

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杨学宁医师 发表于 2022-10-19 23:25:27 | 显示全部楼层 |阅读模式

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Cancer Cell:个体化肿瘤ctDNA可用于监测非小细胞肺癌术后进展[15]

北大人民医院王俊院士团队在Cancer Cell发表了该研究。研究为一项针对早期NSCLC患者的前瞻性研究。研究者首先使用基于全外显子测序数据设计的个性化PROPHET,对181名患者的760个血液样本进行MRD分析。使用LungPlasma ctDNA检测方法,涵盖168个与肺癌相关的基因,通过肿瘤不可知和肿瘤可知两种方法鉴定ctDNA变异,直接比较三种MRD方法。

截图202401100159434824.png


根据PROPHET算法的样本水平P<0.005,假阳性率均低于0.5%。PROPHET在151个术前血浆样本中检测到63个样本的ctDNA(41.7%),IA期、ⅠB期、Ⅱ期、Ⅲ期患者的阳性率分别为15.7%、40.0%、75.0%、82.6%。在91个面板生成的743个ctDNA样本中,18个被检测出阳性,特异性估计率为97.6%。此外,通过PROPHET单独检测到的30名患者的中位数ctDNA分数显著低于三个MRD试验,与基于肿瘤知情分析和肿瘤未知的分析相比,PROPHET在基线上显示出更高的预测力,可用于预测DFS和OS。

在指导临床决策方面,局部复发之前,59.3%的患者中检测出纵向MRD阳性,其中肺复发者为50.0%,纵隔淋巴结转移者为77.8%,远处转移之前的患者为81.0%。在20名有转移部位患者中,脑转移者中有50.0%,腹部转移者中有80.0%,骨转移者中有100%出现了纵向MRD阳性。在放射学诊断中,MRD检测阳性预测值为100%。90天内MRD阴性的10名患者中,80.0%的患者在最后的随访中仍然无病生存。窗口从90天扩大到180天时,可分析的患者数量增加到19人,MRD检测的阳性预测值和阴性预测值分别为87.5%和81.8%。

研究设计
MEDAL-1.jpg


术前血液样本验证
MEDAL-2.jpg

DFS预测分析
MEDAL-3.jpg
Individualized tumor-informed circulating tumor DNA analysis for postoperative monitoring of non-small cell lung cancer: Cancer Cell
Chen K, Yang F, Shen H, et al. Individualized tumor-informed circulating tumor DNA analysis for postoperative monitoring of non-small cell lung cancer [published online ahead of print, 2023 Sep 7]. Cancer Cell. 2023;S1535-6108(23)00286-6. doi:10.1016/j.ccell.2023.08.010
 楼主| 杨学宁医师 发表于 2022-10-19 23:27:10 | 显示全部楼层
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小李 发表于 2023-12-1 22:34:29 | 显示全部楼层

《Cancer Cell》PROPHET定制化浪潮带来的新思考?

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 楼主| 杨学宁医师 发表于 2024-1-5 19:36:18 | 显示全部楼层
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小李 发表于 2024-1-5 19:38:47 | 显示全部楼层
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小李 发表于 2024-1-5 19:41:12 | 显示全部楼层
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