[CTONG1308/CHOICE研究] 中国吸烟肺癌患者的血液、肿瘤及毗邻正常组织样本生物信息学检测的多中心研究

题目
[CTONG1308/CHOICE研究] 中国吸烟肺癌患者的血液、肿瘤及毗邻正常组织样本生物信息学检测的多中心研究


背景
探索中西方肺癌患者基因谱和免疫学的差异，对于中国肺癌患者靶向治疗的选择和发展具有重要意义。

方案
在CHOICE研究中，采用全基因组拷贝数生物芯片技术、全外显子组和转录组二代测序技术产生的多维组学数据，分析了245例中国非小细胞肺癌患者的基因谱和免疫学特征

资料和方法
在CHOICE研究中，采用全基因组拷贝数生物芯片技术、全外显子组和转录组二代测序技术产生的多维组学数据，分析了245例中国非小细胞肺癌患者的基因谱和免疫学特征。
2013年9月至2016年10月在中国6家医院治疗的245名非小细胞肺癌患者的肿瘤和正常样本，共包括腺癌131例，鳞癌114例。大约97%的鳞状细胞癌患者有吸烟史，64%的腺癌患者有吸烟史。

结果
比较了腺癌和鳞状细胞癌患者中高频突变基因、基因融合和其他复发性改变。吸烟者和非吸烟者肿瘤的分子相似性和差异，并与TCGA数据库（主要包括来自西方人群的病例）相比，进一步研究常见于中国非小细胞肺癌的突变。
（1）在没有吸烟史的情况下，东亚女性患肺癌的几率更高，而且EGFR突变频率更高。
（2）与TCGA基因数据库（数据主要来源西方人群）进行比对，发现我国和西方肺癌患者的基因突变即存在相似性，也存在一些不同的基因突变情况。中国CHOICE研究人群染色体上8p23.1丢失的频率较高，而西方人群则染色体上8q24.21的局灶性扩增和肿瘤抑制因子lrp1b的局灶性缺失较高。
（3）在腺癌中发现了EGFR突变与免疫细胞浸润水平相对较低之间的潜在联系，肿瘤浸润淋巴细胞肺腺癌（72.5%）明显高于肺鳞癌（54.4%）；在肺腺癌中免疫细胞浸润低水平与EGFR基因突变有关，且免疫T细胞浸润与KRAS基因突变显著相关，而在肺鳞癌中免疫细胞浸润低水平则与PI3K和/或Wnt途径激活有关。
（4）尽管在更广泛的腺癌中估计有较高水平的肿瘤浸润淋巴细胞。相比之下，带有KRAS突变或扩增的腺癌肿瘤似乎有免疫细胞富集。
（5）研究还采用了肿瘤免疫微环境各浸润炎症免疫细胞成分“去卷积”分析方法，建立了微环境的免疫分子标签，计算每个患者的免疫标签得分，发现具有高抗原呈递机制和细胞毒性T细胞标记评分的鳞癌患者具有较好的预后意义。

结论
中国肺腺癌的免疫细胞标签明显高于肺鳞癌，根据基因组变异、拷贝数增加、融合基因、肿瘤突变负荷和肿瘤浸润淋巴细胞的综合计算，高综合免疫标签的患者几乎是100%的生存，优于其他的免疫标签对预后的预判。

评论
本次CHOICE研究为中国非小细胞肺癌人群中潜在生物标志物的特征提供了全面的描述性数据。这些数据对进一步分析分子标志物、分子机制提供了重要线索。
中国肺腺癌的免疫细胞标签明显高于肺鳞癌，根据基因组变异、拷贝数增加、融合基因、肿瘤突变负荷和肿瘤浸润淋巴细胞的综合计算，高综合免疫标签的患者几乎是100%的生存，优于其他的免疫标签对预后的预判。

存在的问题
用于估计免疫内容物的基因标记只能提示特定免疫细胞类型的相对存在，可能需要进一步完善才能更清楚地观察NSCLC肿瘤内部和周围的免疫细胞。

相似的研究
待查询。

参考文献
Comprehensive genomic and immunological characterization of Chinese non-small cell lung cancer patients. Nature Communications

更新： 2019-04-25

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