分享团队:广东省人民医院张绪超团队
所刊杂志:Translational Cancer Research
文章标题:基于Ion Proton平台的肺癌靶向285基因二代测序方法的建立与应用(Establishment and Application of a Method of Next Generation Sequencing of 285 Genes in Lung Cancer based on Ion-Proton Platform)
内容亮点
该研究初步建立了一种基于Ion Proton测序平台的靶向肺癌285基因深度测序方法,在4种细胞株、24例肿瘤组织和1例血浆上进行了应用,同时利用Sanger测序、IHC、Fish等方法进行了验证,检测到的变异位点均得到了验证。初步建立的NGS方法可同时检测多种SNP、InDel、Fusion和CNV,不仅能检测已知的相关变异位点,还能够发现一些新的未知变异位点。该方法不仅可以检测组织样本,还能够检测细胞样本和血浆样本,有效降低了临床样本的需求量。Ion Proton测序平台多用于PCR扩增方法构建文库的二代测序,本方法另辟蹊径应用靶向探针杂交的方法构建文库进行测序,有效降低了因PCR扩增而引入的错配率,并且应用探针杂交,靶向捕获测序区域更加精确。
第一作者:陈宇
陈宇,20121年毕业于暨南大学,细胞生物学硕士,生物学工程师,毕业后一直从事NGS相关技术研究工作,作为第一作者或共同第一作者的论文发表在Journal of Hematology Oncology,DNA AND CELL BIOLOGY,《中国实验血液学杂志》、《肿瘤防治研究》等杂志上,参与发表SCI论文10余篇。参与了《二代测序技术在肿瘤精准医学诊断中的应用专家共识》的制定。2019年以第8完成人获得了广东省科技进步二等奖,项目名称《T细胞白血病新分子发病机制及其靶向诊治应用》。
通讯作者:张绪超
张绪超,教授,研究员,博士研究生导师。现任广东省人民医院(广东省医学科学院),广东省肺癌研究所所长,广东省肺癌转化医学重点实验室副主任。主要进行肺癌的分子靶点分型、靶向治疗与耐药、免疫微环境及转移的转化性研究,着重在EGFR、KRAS、ALK等临床分子检测及肿瘤发生和耐药机制方面开展研究。获得国家自然科学基金2项,省部级科研基金多项。参与“863”课题及国家自然科学基金多项。参与获得国家科技进步奖二等奖1项、中华医学会医学科技一等奖1项、广东省科技成果奖2项。在Nature communication、Journal of Clinical Oncology、Clinical Cancer Research、Molecular Cancer等杂志以第一作者、共同第一作者或参与作者发表SCI文章四十余篇。作为主要完成人获得国家发明专利2项。主要参与制定CSCO 肺癌主要驱动基因EGFR 、ALK等检测共识制定。目前学术兼职包括:中国临床肿瘤学会(CSCO)理事、CSCO肿瘤生物标志物专家委员会秘书长、CSCO执行委员会委员、中国抗癌协会广东分会理事、广东省转化医学会肿瘤学分会主任委员、广东省抗癌协会肺癌专业委员会常委、广东省抗癌协会靶向与个体化治疗专业委员会副主任委员、广东省抗癌协会分子诊断委员会副主任委员。
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